司马飞燕边城避祸，恰逢孙值的外甥被杀，头颅不见踪迹。县丞求司马飞燕相助。司马飞燕勘验被肢解的尸体后，怀疑是屠户所为，但密查中却发现案件另有隐情，随着县丞被行刺，嫌疑人一个个意外身亡，真相也终于隐现出来。

影片主要讲述了司马飞燕逃亡途中得知当地时有孩童失踪的消息，她暗访中发现此事与山上道观有关，她只身探访险遭猎杀，在老迷糊的提示下她前往双峰山求援，寨主设置难题相要挟，司马飞燕巧妙解局后得到援助，揭开了道观里的真正秘密的故事。

遂州匪患频频几任知府均遭暗杀。彭展奉旨赴任途中再遭人截杀幸遇司马飞燕相救，司马飞燕感到事有蹊跷便假扮师爷护其赴任。果然彭展接任后频遭暗杀幸有司马飞燕相护，司马飞燕巧设计谋竟无意中揭开一张覆盖遂州的黑网。