产生在21世纪初，秋天的内浜地域。 内浜学园迎来历届最高潮的盛况。以执行部为中间举办的各文化学会最大的展示场地?综合学会。 那将是与新校舍建立的同时，决议废弃的旧校舍所进行最后狂欢节日。当然，将由各文化会的会长们率领学生总带动，倾尽全力将这次最后的文化祭导向成功。

动画作品《Little Busters! EX》是Key社出品的游戏《Little Busters!》第三度动画化的作品，前两作分别是《Little Busters!》和《Little Busters! ～Refrain～》。动画将涉及原作游戏的追加版《Little Busters! Ecstasy》（リトルバスターズ! エクスタシー）中的剧情。

故事产生在名为美滨学园的私立寄宿制黉舍当中，高耸的墙壁和森严的轨制让这所仅有五逻辑学员的黉舍成为了与世隔绝的桃花源，某日，一名名为风见雄二（樱井孝宏 配音）的男生转学来到了这里，打破了此处维系多时的平衡，与此同时，雄二亦是学园中独一的男性。　　冷酷寡言的令媛巨细姐榊由美子（田中凉子 配音），大大咧咧毫无防备的周防天音（田…

故事产生在名为三嶋崎的海边小镇之上，私立美滨学园中，来了一名名叫风见雄二（樱井孝宏 配音）的转学生，然而，让雄二没有想到的是，在学园当中只要五逻辑学生，而且全数都是女性，就这样，在小小的高墙当中，雄二的新生活就此睁开。　　拥有美丽外表但性格孤介的巨细姐榊由美子（田中凉子 配 音）、个性开畅活泼，稍稍有些男孩子气的周防天音…

库特与直枝理树成为恋人，顺利结束修学旅行的另一个Little jijikb.com Busters！的世界。男生宿舍在翻修工程中发生漏水事故，导致宿舍无法继续使用。对于走投无路的理树，库特以室友还在募集中…为由伸出援手。就这样开始了和库特一起度过的暑假，这给他们带来了各种各样的新任务。理树和库特最后得到的东西是......？

由于童年的悲惨遭遇，直枝理树（堀江由衣 配音）的个性变得十分孤僻。长着一张娃娃脸，沉默寡言，没有朋友，这样的理树成为了大家眼里的怪胎。某一日，性格傲娇爱猫如命的枣铃（民安智惠 配音），正直开朗稳重可靠的枣恭介（绿川光 配音），四肢发达头脑简单的井之原真人（神奈延年 配音），成熟勇敢剑术一流的宫泽谦吾（织田优成 配音）四人出…

平静略显无聊的日子里，枣恭介（绿川光 配音）、枣铃（民安智惠 配音）、井之原真人（神奈延年 配音）、宫泽谦吾（织田优成 配音）以及直枝理树（堀江由衣 配音）等Little Busters的各位坐在一起聊天。真人讨厌被大家成为宇宙笨蛋，恭介则适时提出了强者挑战赛，拿到冠军自然有机会为自己正名，此外他还为在场的各位设定了种子排位。在此之后，…

幼时曾深陷绝望深渊的直枝理树，与4位少年少女相遇了。　　在那之后数年，理树作为Little Busters的一员，喧闹地过着快乐的每一天。　　这样的时间能够一直持续就好了。理树所期望的只有这样。　　某日，恭介突然表示要成立一支棒球队伍，　　理树则开始了寻找成员的任务。　　在这样的过程中，理树邂逅了新的成员们。　　和大家一起参加试胆大…